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弥合间隙:慢而精的 DNA 修复研究

⏱️ 阅读时长 7 分钟 | 您的身体组装 DNA 的过程就像一支铺设并粘合瓷砖图案的工人团队。最近的一项研究…

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当您的身体制造新的 DNA 或修复受损的 DNA 时,会得到一种名为 LIG1 的特殊蛋白质的协助。如果铺设 DNA 就像排列瓷砖图案,那么 LIG1 就是负责检查瓷砖并密封瓷砖间隙的助手。一些亨廷顿病(HD)患者拥有一种名为 LIG1 K845N 的替代版本,这种版本可以推迟他们出现 HD 症状的时间。一组科学家现在报告了这种替代版本的 LIG1 可能是如何推迟 HD 发病的,以及它是否能为开发有效疗法指明方向。

铺设瓷砖与密封间隙

如果您见过房屋装修,就会知道铺设瓷砖图案是最精确、要求最高的工作之一。瓷砖必须完美排列以符合预期的图案,并且还要精心留出间隙,以便能均匀地密封瓷砖之间的缝隙。

当您的身体制造新的 DNA 或修复受损的 DNA 时,它会铺设一种名为核苷酸(A、G、C 或 T)的特殊化学“瓷砖”图案,然后用化学键将它们密封在一起。

在 HD 患者中,一系列由三个 DNA 瓷砖(CAG)组成的序列会一遍又一遍地重复,连续重复 40 次或更多次。

推迟 HD 发病的“铺砖助手”

在您体内排列新 DNA 瓷砖图案的蛋白质被称为 聚合酶。而检查 DNA 瓷砖图案并将瓷砖粘合在一起的助手被称为 连接酶。有许多聚合酶和连接酶协同工作,以确保 A、T、G 和 C 核苷酸瓷砖被正确组装并粘合在一起。这项研究专注于一个名为 LIG1 的助手。

LIG1 与 HD 有什么关系?在某些人身上,存在一种替代版本的 LIG1,就像是一个替代的铺砖助手在顶班工作。这种替代的 LIG1 有一个特定的变化,使其工作方式略有不同,就像一个使用不同灌浆工具的助手。

这种变化被称为 K845N。这听起来可能像《星球大战》中机器人的名字,但实际上它为科学家提供了变化的遗传坐标——在第 845 个位置,一个 K 蛋白构建块(赖氨酸)被替换成了 N 蛋白构建块(天冬酰胺)。

值得注意的是,携带 K845N 变体 LIG1 的 HD 患者,其症状出现的时间比预期晚得多,平均晚 7 到 8 年。研究 HD 的科学家们对这种替代的 LIG1 K845N 如何引起如此深刻的变化非常感兴趣,并探讨它是否能帮助他们找到减缓疾病的方法。

组装您体内的 DNA 马赛克是聚合酶(负责铺砖)和连接酶(负责粘合瓷砖间隙)之间团队合作的结果。有时聚合酶会铺错瓷砖,但某些连接酶会进行质量控制,只粘合正确的瓷砖 图片来源:
Bimbim Sindu

对决:比较常规 LIG1 和替代 LIG1 的工作表现

从事同一份工作的人有时会以略有不同的方式开展工作。想象一下,一个服务员用右手把盘子端到桌子上,而另一个服务员用左手以不同的方式端盘子。通常这不会影响最终结果(食客收到食物),但偶尔也会有影响(也许某种端盘子的方式在服务员被撞到时更不容易摔落)。

在 LIG1 和 LIG1 K845N 的案例中,这两个助手在检查和粘合 DNA 瓷砖方面的差异,改变了 HD 症状出现的时间。

一位更慢、更细心的助手

在连接酶(粘合助手)之前工作的聚合酶(铺砖工)有时会铺错瓷砖,而 LIG1 有时能发现这个错误。

一组科学家设计了巧妙的实验,以测试常规 LIG1 和 LIG1 K845N 在面对正确和错误放置的 DNA 瓷砖时是否表现不同。研究人员首先测试了这两个不同版本的 LIG1 粘合正确匹配瓷砖的效率。有趣的是,他们发现 LIG1 K845N 的工作速度更慢。也许这就是为什么 LIG1 K845N 不是常规岗位人选的原因——常规 LIG1 速度更快!

但当科学家向常规 LIG1 和 LIG1 K845N 展示 错配 的 DNA 瓷砖时,情况变得有趣了。科学家是故意这样做的,但负责铺设 DNA 瓷砖的聚合酶在为 LIG1 安排待检查和粘合的新瓷砖时,有时也会犯这种错误。

哪种 LIG1 在发现错误方面做得更好?常规 LIG1 通常还是会直接把错误的瓷砖粘合在一起,但 LIG1 K845N 通常会停下来,而不是粘合错误的瓷砖。所以 LIG1 K845N 虽然工作较慢,但似乎在检查 DNA 瓷砖是否匹配方面更加细心。

连接酶将 DNA 瓷砖粘合在一起。一些连接酶粘合瓷砖的速度较快,但偶尔会固定错误的瓷砖;而另一些连接酶粘合瓷砖的速度较慢,但能避免错误。一种名为 LIG1 K845N 的特殊连接酶工作起来更慢、更细心 它也能延缓人类亨廷顿病的发病。

LIG1 K845N 可能会减缓 CAG 重复序列的体细胞扩增

进行这项研究的科学家们还不确定 LIG1(快而粗心)和 LIG1 K845N(慢而细心)之间的这种差异是如何在人体内发挥推迟 HD 作用的。但研究表明,其他相关的蛋白质(称为错配修复蛋白)可以通过一种称为“体细胞扩增”的过程,增加大脑中重复 CAG 瓷砖的数量。

LIG1 K845N 是否能以某种方式改变重复 CAG 瓷砖变长的过程?也许这就是 LIG1 K845N 推迟人类 HD 发病的原因。

为了回答这个问题,研究人员研究了具有极长 CAG 重复序列的 HD 小鼠。这些小鼠也表现出体细胞扩增,这意味着随着时间的推移,它们大脑某些细胞中的重复 CAG 瓷砖会变得越来越长。研究人员随后使用了一些您可能听说过的神奇新工具(CRISPR 技术),将人类 LIG1 K845N 植入这些 HD 小鼠体内,并测试其对体细胞 CAG 扩增的影响。

值得注意的是,携带 LIG1 K845N 的 HD 小鼠比携带常规 LIG1 的 HD 小鼠体细胞 CAG 扩增更少,这意味着 CAG 瓷砖数量增加的速度更慢。

这与科学家根据 LIG1 K845N 减缓人类 HD 症状的预期相符。这也表明,LIG1 K845N 检查和密封 DNA 瓷砖的特殊方式,也以某种方式减少了体细胞 CAG 扩增。

仍有更多工作要做

一个重要的注意事项是,这些实验是在为研究 HD 而设计的细胞或小鼠中进行的。科学家们并没有直接在人体中测试 LIG1 K845N 的效果。

但他们的结果表明,LIG1 检查和粘合 DNA 瓷砖的方式确实在某种程度上减缓了人类体细胞 CAG 的扩增。这项研究为越来越多的证据提供了支持,即体细胞 CAG 扩增可能是人类患上 HD 的重要步骤,而减缓这一过程可能有助于缓解病情。

对于针对 HD 患者体细胞扩增的药物开发来说,这又是一个好消息。

摘要

  • 您的身体通过一支由铺砖工(聚合酶)和助手(连接酶)组成的团队来组装 DNA,他们负责检查并将 DNA 瓷砖粘合在一起。
  • 某些人身上的一种名为 LIG1 K845N 的特殊连接酶可以减缓 HD 的发展。
  • LIG1 K845N 粘合 DNA 瓷砖的速度较慢,但检查瓷砖准确性的细心程度更高。
  • LIG1 K845N 可能通过减少 CAG 重复序列的体细胞扩增来减缓 HD。

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