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DNA 上的拔河:亨廷顿舞蹈症重复序列如何增长与缩减

来自瑞士的一项新研究揭示了我们细胞内的亨廷顿舞蹈症基因中,CAG 重复序列数量是如何增长或缩减的。

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自从亨廷顿舞蹈症 (HD) 的大型遗传学研究揭示了 CAG 扩增越长,症状出现越早以来,我们就已经知道重复序列的长度至关重要。最近的研究强调了易受损脑细胞内的重复序列长度是如何增加的——从大约 50 个 CAG 增加到一千多个。

了解这些扩增是如何发生的,以及它们如何影响疾病,对于开发正确的治疗策略至关重要。我们能否纠正受影响细胞中扩增的 DNA?嗯……也许细胞自己就能做到!

分子拔河赛中的参与者

DNA 修复基因能强烈影响 HD 症状开始的时间。多年来,研究人员一直在问:这些基因究竟对导致 HD 的缺陷 DNA 片段做了什么?我们能否利用这些知识来推迟症状的出现——或许推迟到疾病永远不会发生?

Petr Cejka 团队在《自然-通讯》(Nature Communications) 上发表的一项新研究,逐个分子地重建了两个对立的 DNA 修复团队如何在我们的细胞内竞争。一个团队在尝试修复时错误地延长了 CAG 重复序列,而另一个团队则将其修剪。这种精妙的生化剖析终于展示了为什么像 MSH3、MLH3 和 FAN1 这样的参与者对疾病发作有如此强烈的影响,并为减缓甚至预防 HD 开辟了新途径。

为什么 DNA 修复在 HD 中至关重要

DNA 储存在细胞核中,形成双螺旋结构,每条链上的字母精确配对,就像拉链上匹配的齿一样。

但当亨廷顿蛋白 (HTT) 基因中的 CAG 序列变得太长时,链条就无法完美对齐。一侧可能会出现多余的“齿”,产生从螺旋中凸出的错配——科学家称之为挤出环(想象一下一侧有扭结的拉链!)。

每个人在他们的 HTT 基因中都继承了一些 CAG 重复序列,但通常情况下,拥有 40 个或更多重复序列的人最终会患上这种疾病。当这些重复序列变长时,DNA 就无法整齐地拉合,细胞的修复机制就会冲过去修复它。这就是拔河游戏的开始。修复可以有两种结果:一些机制复合物会平整并稳定 DNA,而另一些则会意外地使重复序列变得越来越长。

“扩增组”:MutSβ 和 MutLγ

DNA 修复通常像拼写检查器一样工作,扫描 DNA 复制时出现的错误、错配或小环。然而,在 HD 中,部分修复团队反而制造了问题。

这实际上是作用于同一重复序列的两种 DNA 修复途径之间的拔河。哪一方获胜可能决定了特定细胞中 CAG 是增长还是缩减。

两个复合物——MutSβ(由 MSH2 + MSH3 组成)和 MutLγ(MLH1 + MLH3)——会识别形成大量 CAG 重复序列时产生的挤出环。扩增组并没有移除这个环,而是将该环作为模板并填入额外的 CAG。结果呢?重复序列变得更长了。MutSβ 和 MutLγ 将正常的修复工作变成了扩大 CAG 数量的“复制粘贴”错误。

“缩减组”:FAN1 前来营救

轮到 FAN1 登场了,它是一种核酸酶——本质上是一把分子剪刀——可以起到相反的作用。FAN1 识别这些 DNA 环并直接在问题部位进行切割。FAN1 团队与辅助蛋白合作,移除多余的重复序列,而不是添加新的。

FAN1 还有一个聪明的绝招:它能从物理上阻断 MutLγ 与 MutSβ 的结合,在扩增机制开始之前就将其停止。

一场分子拔河

在“扩增”途径中,MutSβ 和 MutLγ 在 CAG 环的对面切开 DNA,让 Pol δ 复制额外的碱基并使重复序列变长。FAN1 识别相同的 DNA 环并直接切割它,允许 Pol δ 移除多余部分,从而使重复序列缩减。

通过在试管中并排设置这两个反应,团队揭示了作用于同一 HTT 重复序列的两种 DNA 修复途径之间真正的拔河。哪一方获胜可能决定了特定细胞中 CAG 是增长还是缩减。

将生物化学与人类遗传学联系起来

发现 DNA 修复基因会影响症状出现的时间并非凭空而来——它始于全基因组关联研究 (GWAS),这些研究得益于数千名 HD 患者捐赠的 DNA 样本。这些大规模研究在整个基因组中搜索改变发病年龄的遗传变异。明确的信息是,涉及 DNA 修复的基因——如 MSH3、MLH3 和 FAN1——是主要参与者。

这个新的生化模型完美地解释了为什么那些 GWAS 信号指向修复基因。增强 MutSβ 或 MutLγ 活性(在 MSH3 或 MLH3 中)的变异会加速 CAG 扩增并导致症状提前出现,而增强 FAN1 活性的变异则可以减缓扩增并推迟发病。

科学家们长期以来一直观察到这些相关性——现在,多亏了 Cejka 团队的分子重建,我们终于可以将人类遗传学与可能驱动亨廷顿舞蹈症的实际 DNA 化学过程联系起来。

如果这个模型成立,它可能会开辟一条全新的治疗途径——针对 DNA 修复本身来推迟甚至预防亨廷顿舞蹈症。

为何如此重要

了解这些精确的机制不仅是迷人的生物学,它还是我们开发疗法的路线图。如果我们能将平衡向缩减或稳定倾斜,我们就有可能减缓甚至停止疾病过程本身。

一些公司已经在追求这个想法:

  • Ionis Pharmaceutical、LoQus23 Therapeutics 和辉瑞 (Pfizer) 正在开发针对 MSH3 的 ASO 或 MutSβ 抑制剂,旨在降低扩增活性。
  • Harness Therapeutics 正在尝试增强 FAN1 的功能,或模仿其对 MutLγ 的阻断作用,这可能提供另一种保护 HTT 免受失控扩增的途径。

接下来是什么?

尽管强有力的证据表明体细胞重复序列扩增驱动了症状开始的时间,但这仍然是一个工作模型。研究人员现在正试图绘制这些修复过程在不同脑细胞类型中的差异,以及它们在活体组织中是如何相互作用的。

了解细胞如何自然地纠正自身的 DNA 错误,可能会激发让细胞从内部修复亨廷顿舞蹈症的治疗方法。

关键的挑战在于平衡:有时会延长 HTT 重复序列的同一套 DNA 修复系统,同时也在保护我们基因组的其余部分。最终目标将是微调这些途径,以抑制 CAG 扩增,而损害其他地方的 DNA 完整性。

如果这个模型成立,它可能会开辟一条全新的治疗途径——针对 DNA 修复本身来推迟甚至预防亨廷顿舞蹈症。

摘要

  • HD 的发病受到涉及 DNA 修复基因的强烈影响。
  • MutSβ (MSH2–MSH3) 和 MutLγ (MLH1–MLH3) 协同切开 CAG DNA,添加额外的重复序列。
  • FAN1 及其团队则切割 CAG 环,移除多余的重复序列。FAN1 还会阻断 MutSβ–MutLγ 的伙伴关系,防止扩增。
  • 这些相反的反应解释了为什么增强 FAN1 或降低 MLH3/MSH3 活性可以推迟 HD 的发病。

了解更多

MutSβ–MutLγ 导致三核苷酸重复序列扩增以及 FAN1 导致其缩减的机制。

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