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对中间 CAG 重复序列的新见解:绘制扩展连续体

一项新的研究使用超灵敏的研究技术来绘制整个 CAG 重复序列长度范围内的 DNA 变化,揭示了中间重复序列在遗…

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为什么一些具有中间 CAG 重复序列(亨廷顿舞蹈病中的遗传“灰色地带”)的人会出现神经系统症状,而另一些人则不会?本文介绍了一项最新的研究,该研究通过寻找体细胞扩增来解决这个问题,体细胞扩增是指不同 CAG 重复序列大小的个体中 DNA 的微小变化。该团队使用超灵敏的研究技术对血液样本进行分析,发现中间 CAG 重复序列确实会发生扩增,但这些变化通常非常小。虽然这证实了中间重复序列是遗传不稳定性的连续谱的一部分,但该研究发现血液中的这种扩增与症状的存在之间没有明确的联系。本文介绍了这项新研究揭示的关于 HD 遗传图谱的信息。

HD 灰色地带

当人们的 huntingtin 基因中 C-A-G 遗传字母重复出现时,就会发生亨廷顿舞蹈病 (HD)。具有 40 个或更多重复序列的人会在一生中患上该疾病,而具有 36-39 个重复序列的人则具有科学家所说的“降低的外显率”,这意味着有些人会出现症状,而另一些人则不会

27-35 的重复序列长度被称为“中间等位基因”。“中间”是指重复序列落在将导致和不会导致疾病的范围之间,而“等位基因”是指某人从其父母那里遗传的 huntingtin 基因的副本。虽然这些重复序列长度不被认为是致病的,但它们给家庭带来了不确定性。这些中间等位基因在从父母传给孩子时会发生扩增,可能会在下一代中达到致病长度。此外,一些具有中间 CAG 数值的人会出现神经系统症状,尽管低于传统的 HD 阈值。

这种情况将中间 CAG 长度置于有争议的“灰色地带”,提出了根本性的问题:这对未来意味着什么?这些 DNA 序列是否会在一个人的生命周期内随着时间的推移而发生变化?这种变化能否解释为什么一些中间等位基因携带者会出现症状,而另一些人则不会?

先进的研究技术揭示了中间长度重复序列中小的但可检测到的体细胞扩增,这些扩增是标准测试无法检测到的,但这些变化并未明确解释症状的发展。

研究问题

科学家们早就知道,DNA 会通过各种过程在一个人的生命周期内发生变化。有些过程很简单,例如由阳光照射造成的损伤引起的突变,而另一些过程则更复杂且了解较少。最近HD 研究中涉及 DNA 变化的热门话题是一个称为“体细胞扩增”的过程。

体细胞扩增是一种生物过程,其中 CAG 重复序列会随着时间的推移在具有 HD 基因的人的身体的不同细胞中扩增。有趣的是,这些扩增往往在 HD 中最容易死亡的脑细胞类型中最大。许多研究人员认为,这些不断增加的 CAG 扩增可能会导致症状何时以及如何发展。

由 Maria Ramos-Arroyo 博士领导的一个研究团队测试了以下观点:具有中间 CAG 重复序列的人也可能经历体细胞扩增,这可以解释为什么一些中间 CAG 重复序列携带者会出现神经系统症状,而另一些人则不会。为了验证这一观点,他们使用了超灵敏的 DNA 测序技术来研究整个 CAG 谱中的 355 人,其中包括 191 名具有中间重复序列长度的个体。

研究结果

超灵敏技术揭示微小变化

该团队对本研究中人们的血液样本使用了一种非常敏感的测试,称为 MiSeq(发音为“my seek”)测序。MiSeq 是一种足够敏感的技术,可以检测到常规基因检测会遗漏的 DNA 变化。由此,该团队发现具有中间 CAG 重复序列的人确实会经历体细胞扩增。但是,这些变化非常小。当发生扩增时,通常仅限于一小部分 DNA 分子中仅增加一到两个 CAG 重复序列。

遗传长度比时间更重要

研究人员还在影响这些扩增的因素中发现了一个重要的模式。遗传的 CAG 重复序列大小的长度对体细胞扩增的影响远大于年龄。对于中间 CAG 重复序列,遗传序列中每个额外的 CAG 重复序列对扩增的影响大约是每增加一岁的影响的 40 倍。这是一个巨大的差异!

这些中间等位基因在从父母传给孩子时会发生扩增,可能会在下一代中达到致病长度。此外,一些具有中间 CAG 数值的人会出现神经系统症状,尽管低于传统的 HD 阈值。

出现连续模式

结果提醒我们,CAG 长度代表一个连续的谱,而不是不同的类别。数据显示,体细胞扩增行为遵循一个清晰的连续体。具有较长遗传 CAG 重复序列的人表现出逐渐增加的扩增,中间 CAG 长度自然地位于正常长度和致病长度之间。这证实了中间长度重复序列不是一个单独的生物学类别,而是这个更大谱的一部分。

大脑显示出比血液更高的扩增率

当研究人员检查了一名具有 33 个 CAG 重复序列并出现症状的人的脑组织时,他们发现大脑区域显示出比血液更高的扩增率,其中与运动相关的脑区域(壳核)显示出最大的变化。这与在 HD 患者中看到的模式相匹配,但重要的是要记住,此分析仅限于单个个体。

与症状没有明确的联系

重要的是,这项研究发现体细胞扩增与中间 CAG 重复序列携带者的症状之间没有明确的联系。研究人员研究了 78 名具有中间 CAG 长度且有神经系统症状的人(85% 有运动症状,27% 有认知症状,29% 有行为症状),但与无症状携带者相比,他们的血液扩增水平似乎没有差异。这表明仅靠体细胞扩增并不能解释为什么这些人有 HD 症状,而其他具有相似中间 CAG 长度的人却没有。

CAG 重复序列的体细胞不稳定性存在于一个连续的谱中,形成一个梯度而不是单独的类别。

这些结果意味着什么?

对于中间重复序列长度的携带者及其家人来说,这些发现不会改变当前的临床实践或预测性测试。由于血液中体细胞扩增水平与神经系统症状的存在之间没有明确的联系,这意味着测量中间长度的人的 CAG 扩增不能用于预测个人的未来健康状况。此外,由于涉及体细胞扩增的遗传变化只能通过先进的研究方法检测到,因此家庭可用的标准基因检测无法识别它们。

从科学的角度来看,确认 CAG 长度的连续谱是向前迈出的重要一步。它表明中间 CAG 长度遵循与导致 HD 的重复序列长度相同的遗传过程,只是水平低得多。

但是,在利用这些发现帮助 HD 家庭了解中间长度携带者是否会发展出疾病症状方面仍然存在障碍。本研究的设计仅捕捉了时间上的快照,而不是多年来跟踪个体,这限制了我们对这些变化如何发展的理解。此外,检测这些细微扩增的难度限制了可以进行的研究规模。

但是,即使在中间范围内,CAG 重复序列也具有以下附加知识:1) 存在于一个连续体上,2) 也会经历重复扩增,并且 3) 有时与症状相关,这使研究人员对 HD 有了更好的了解。有了这些信息,科学家们可以努力取得进步,最终让我们更好地了解影响症状发展的因素。

结果提醒我们,CAG 长度代表一个连续的谱,而不是不同的类别。

未来的研究方向

研究人员可以基于这些发现并提出关于谁将继续发展症状以及为什么的问题。为此,科学家们需要考虑本研究中确定的研究障碍。

前进的道路可能需要更详细地跟踪人们随着时间的推移以及更大规模的研究相结合。多年来跟踪个体将使研究人员能够跟踪随着年龄增长的同一人中的遗传变化和症状进展。扩大到更多的人数也将是有价值的,尽管考虑到本研究中使用的基因测序测试的特殊性质,这仍然具有挑战性。更易于访问的生物标志物可以促进更大规模的研究。

这项研究提供了huntingtin基因遗传图谱的更详细地图,证实即使是具有中间 CAG 重复序列长度的人也是体细胞不稳定性连续体的一部分。虽然它没有建立这种不稳定性与症状之间的联系,但它清楚地定义了下一个研究步骤的挑战和优先事项,这些步骤可以帮助科学家了解谁将继续发展症状或不会发展症状。

摘要

  • 体细胞 CAG 扩增发生在连续体上:中间 CAG 长度显示出小的但可检测到的扩增,这符合我们在完整 HD 扩增中看到的相同模式。
  • 扩增与症状之间似乎没有明确的关系:在本研究范围内,血液中体细胞扩增的水平并未明确解释为什么一些具有中间 CAG 重复序列长度的人会出现症状,而另一些人则不会。
  • 需要更多的研究:跟踪人们随着时间的推移进行更大规模的研究对于更好地了解中间 CAG 重复序列长度的人的症状发展至关重要,并且可能会通过更易于访问的生物标志物得到改善。

了解更多

原始研究文章,“HTT 基因中间等位基因中的体细胞 CAG 重复序列不稳定及其与临床表型的潜在关联”(开放获取)。

Sarah Hernandez 是亨廷顿舞蹈病基金会 (HDF) 的员工。本文是 HDF 的 HD-职业发展资助计划的一部分,该计划为年轻研究人员提供通俗科学传播方面的指导培训。

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